台灣教授協會對於國家安全局開放全部檔案與轉型正義的後續工作有以下四點聲明。

一、國家安全局宣布解密開放戒嚴時期所有政治檔案，並完全不遮蔽移交給檔案局，對台灣轉型正義的進一步推動，給了相當大的助力。作為威權時期台灣體制上最高情治單位，國家安全局的態度是相當值得肯定的，期待其他單位可以跟進（如果同一份檔案有在中國布建的部分，既與國內政治事件無關，又牽涉到當事人的安全，則要注意遮蔽）。

二、檔案管理局加速整理開放，也要注意人力的補充。不過檔案開放，有待進一步彙整、研究，甚至考證，更有利於國人對相關事件的瞭解。建議應該將國內對此一檔案史料編纂工作，及中華民國史與戰後台灣史研究人力最充足（實際上還是不夠）的國史館納入政治檔案研究機關。

三、以林宅血案為例，過去監察院與促轉會都有相關的調查報告，由於有調閱檔案權限，過去就曾指出有哪些重要的線索曾經被有意忽視甚至誤導，而影響案發之時的偵辦工作。建議由政府高層或是相關權責單位出面，再召開記者會，舉出目前掌握的資訊，以及可以繼續追查的方向。這對前一陣以訛傳訛的爭議問題，至少可以起釐清作用。

四、檔案開放與真相研究固然密切相關，但是檔案的內容來源不一，未必為真，甚至也有當時的錯誤資訊，這是應該提醒國人注意的。